Ham suyun kalitesi, ters ozmoz sisteminden gelen atık su miktarı üzerinde önemli bir etkiye sahiptir. Ham sudaki çözünmüş katı maddeler, kirletici maddeler ve sertlik ne kadar yüksek olursa, membran tıkanmasını önlemek için sistemin atık suyu o kadar sık ​​tahliye etmesi gerekir.